冷冻人体哪些参数影响RNA质量?
来源: 2017-01-16
现今医学研究项目越来越依赖于高质量的生物储存组织,主要是由于从组织中提取的RNA质量影响基因表达的可靠性。因此,本研究的目的是为了确定是否有临床参数、外科参数、组织学参数和分子参数影响冻存的正常和肿瘤结肠组织。我们收集2010年10月到2012年12月期间冻存的241例腺癌和115例匹配的正常结肠组织用来评估RNA质量指标(RQI)。对影响RQI结果的患者年龄、性别、肿瘤部位,手术类型,吻合术失败,腺癌类型和分级,肿瘤细胞百分比,肿瘤组织坏死程度,HIF-1α和cleavedcaspase-3免疫组化染色,BRAF,KRAS和微卫星状态进行比较。结肠癌组织中的RQI结果明显高于匹配的正常组织。左半结肠癌RQI结果明显高于右半结肠癌。RNA质量不受缺血时间和储存时间影响。根据组织学对照,由于采样不足,有7.9%的样本不符合要求。RQI≥5的肿瘤组织,其恶性细胞与间质细胞的比例低于RQI < 5的样本。细胞性质,坏死程度和黏液成分不影响RQI结果。Cleaved caspase-3 和 HIF-1α免疫标记结果显示,其与RQI不相关。BRAF,KRAS和微卫星分子状态不影响RNA质量。多变量分析揭示肿瘤部位,外科手术路径(腹腔镜辅助的结肠癌切除术对比开放式结肠癌切除术)和吻合口瘘发生是明显影响肿瘤组织RQI结果的仅有参数。我们未能确定影响正常结肠样本RQI的参数。这些数据揭示结肠腺癌生物样本的RNA质量由临床和外科手术参数所决定。我们应该更关注于右半结肠癌或腹腔镜结肠切除样本的储存程序。组织学质量对照仍是控制采样准确性的关键因素。
根据文献报道,胃肠道组织尤其是结肠组织的RNA质量明显低于来自其他器官的RNA质量,因此对该类组织中影响RNA质量参数的鉴定是非常必要的。本文选择结肠腺癌组织和匹配的正常结肠组织作为研究对象,探究临床、组织病理和分子因素对RNA质量的影响。结果显示,肿瘤组织中的RNA质量高于正常组织,肿瘤部位、手术路径、吻合口瘘发生、恶性细胞与间质细胞的比例影响肿瘤RNA质量。另外,RNA质量与分析前变量、形态学或分子状态等参数没有关联。同时研究结果表明,行腹腔镜切除术的肿瘤样本和右半结肠肿瘤样本取样和解释分子实验结果时应更加仔细,以减少对RNA质量的影响。