Nature正式报道“韩春雨事件”
来源:科学网 2016-08-09
按: Nature 正式发文就近几个月来持续发酵的 “ 韩春雨时间 ” 给出了一个详细的报道,题为《 Replications, ridicule and a recluse: thecontroversy over NgAgo gene-editing intensifies 》,作者《 Nature 》杂志亚太通讯员 David Cyranoski 教授。此外,同时 Nature 也以《 Beyond CRISPR: A guide to the many other ways to edita genome 》为题的一篇文章中也提及了 NgAgo 。
以下是 Nature 报道文章的译文(不准确之处敬请谅解):
关于“诺奖”级别的基因编辑“神器 ” NgAgo 是否能替代 CRISPR-Cas9 的争论仍在急剧发酵。
三个月前,石家庄河北科技大学的韩春雨报道说 NgAgo 可以用来编辑哺乳动物基因组。截至目前越来越多的科学家抱怨说韩的结果根本无法重复—— 尽管仍有一人告诉 Nature 说他自己可以。
韩说他每天接到十几个急急忙忙的电话和短信嘲弄他,说他的职业生涯即将结束—— 但韩仍确信说该技术是可信的。韩也告诉 Nature 说应 addgene 的要求, 8 月 8 号他已经向 Addgene 提交了详细的 protocol (实验细节), 并希望这些举措可以帮助其他科学家尽快重复出他的结果。发表其论文的 Nature Biotechnology 杂志也已经开始调查此事。
尽管韩春雨每天都要接到数十个电话询问,但是他仍然坚信他的基因编辑论文是没有问题的。
但风险仍然很高。过去几年, CRISPR–Cas9 系统已经改变了生物学的研究,但研究者们仍孜孜不倦追求其他的基因编辑工具: NgAgo 只是其中一个。“我们中的很多人都坚定的支持这一发现,并希望 NgAgo 真的能起作用,哈佛医学院遗传学家 George Church 如是说。
在论文中,韩的团队报道说使用一些列不同的序列来指导 NgAgo 可以在人的细胞内编辑 8 个不同的基因,也可以在染色体特异位点敲入目的基因 ( F. Gao et al. NatureBiotechnol. 34, 768–773;2016 ).
韩说,最为重要的是 NgAgo 只特异性针对目的位点进行切割,这要优于脱靶效应的 CRISPR–Cas9 系统。韩还补充说, CRISPR–Cas9 系统还依赖 PAM 序列来起始切割事件,而 NgAgo 并不需要,这更加拓宽了 NgAgo 的使用范围。
在中国这一工作得到了极大的褒奖,包括 CCTV 参观了韩的实验室。韩是一个比较低调的人,其兴趣包括收集茶叶和弹奏古琴。但韩说这一工作的影响是空前的。其实韩不喜欢旅行,也从未走出过国门: 今年 3 月份去杭州会见合作者是其 42 年来第一次乘坐飞机。在文章发表之前,“完全没有人知道我”,韩在实验室及附近的宾馆里对 Nature 这样说。
七月初,当打假专业户方舟子在新语丝 ( xys.org ) 开始质疑这一工作的可重复性的时候,真正的怀疑才真正到来,批评的声音也充斥着中国的各个媒体。
方舟子
7 月 29 日,当澳大利亚国立大学的遗传学家 Gaetan Burgio 在其博客中公开了重复实验失败的各种细节的时候,预示着这一争论正式走向国际化。平时,他的博客帖子点击量不过几十,但这次却一下子超过了 5000 。
Gaetan Burgio
就在同一天,位于马德里的西班牙国家生物技术中心的遗传学家 Lluís Montoliu 给国际转基因技术协会会员发了一封邮件,邮件中提到 “ 放弃任何与 NgAgo 有关的实验,请不要再浪费时间、金钱、动物和人力 ” 。随即这封邮件被泄露,然后出现在了方舟子的新语丝网站上。
Lluís Montoliu
自此以后,一名 MRC 中心(英国爱丁堡再生医学中心)的分子生物学家 Pooran Dewari 进行了一次在线调查,最后他发现只有 9 名研究人员声称 NgAgo 是有效的,然而 97 名研究人员表示不能重复。 DebojyotiChakraborty 是来自新德里的基因与综合生物学研究所的博士,他曾重复了韩春雨论文章的几个实验,也就是运用 NgAgo 系统敲除外源转入的 GFP 基因。确实, GFP 荧光有所下降,但是目前并没有证据显示这里面发生了基因编辑。然后他表示, GFP 荧光的减少可能是其它原因造成的。
两名最初报道他们成功重复 NgAgo 的研究人员在一个在线聊天室中说他们被误导了。
Jan Winter ,一名来自位于海德堡的德国癌症研究中心的 PhD 学生说道,他有一个相似的经历,表示 “ 我将在未来的几周内重复这个实验,但是到目前为止我认为它( NgAgo )是无效果的 ” 。
韩春雨表示,只有在他们实验室培养的细胞中运用这套 NgAgo 系统有效的,但是他们购买的细胞系却重复不出同样的结果。韩随后发现他们购买的细胞是有支原体污染了,而这可能就是问题所在。韩又提到,许多研究生可能实验做得太快而没有留意一些试剂。但是 Jan Winter 表示异议, “ 我不认为这是个科学家都会做错的问题 ” 。
一名不愿透露姓名(不想被卷入公共争论)独立于韩春雨实验室之外的中国研究人员告诉 Nature ,他们在好几个细胞系检测了 NgAgo 系统是否有效,而且他们的结果显示 NgAgo 能够在预期的位点诱导遗传突变 —— 这一结果已经通过测序鉴定。他又提到, NgAgo 系统的效率并没有比 CRISPR-Cas9 高,但是可能还要后续调整改进。 “ 但是总的来说 NgAgo 是有效( But, in short,it worked ) ” ,这名科学家最后提到。
两名要求匿名的中国科学家提到,他们有了一些初步的试压结果显示 NgAgo 是有效的但是仍然需要进一步测序去确认。
Burgio 说到, “NgAgo 可能,可能是有效的。但是即便是这样,仍然面临很多挑战, NgAgo 不值得继续进行,因为它绝不会超越 CRISPR” 。
荷兰瓦赫宁根大学微生物学家、 2014 年一篇有关 TtAgo 蛋白在高温下进行基因编辑的 Nature 文章中的通讯作者 John Van der Oost 评论到, NgAgo 的失败 “ 是令人失望的,但是留给我们要做的是去看是否其它 Argonaute 蛋白系统是否能够运用 ” 。
2014 年 Nature 发表的有关 TtAgo 蛋白的工作
就在几天以前,《自然 . 生物技术》杂志将一份声明提交给了《 Nature 》新闻团队,并提及 “ 数名研究人员 ” 联系了该杂志并报告他们并不能重复韩春雨的实验结果, “ 该杂志随即表示将按照既定流程调查此事 ” 。一位发言人拒绝就调查性质和持续时间发表评论(《自然 . 生物技术》由 Nature 集团出版,但是 Nature 新闻评论团队是独立于出版商的研究编辑团队的。)。
这篇文章引述新华社英文帮的一篇题为《 China Focus:Chinese geneticist defends high-profile findings 》文章提到,韩春雨所在的河北科技大学表示在一个月之内,韩春雨将采取适当形式公开验证,届时将有权威第三方作证。
Nature 引述新华网英文版的报道
以上是关于 Nature 对韩春雨事件的报道,有鉴于此, BioArt 采访了一名不愿透露姓名的从事基因编辑研究的专家,他对今天的 Nature 文章评论专门撰文评价道:
nature 教我们的媒体重新学习做新闻
2016 年 8 月 8 日, nature 的 news 版, David Cyranoski 刚刚发文,给我们示范了应该如何公开报道热点事件,其文风值得国内(或者中文语境下)所有公开参与报道争议的相关各方学习。
此文并没有试图平息 NgAgo 引发的争议,只是客观地摆出了一些事实及各方当事人的说法,报道者严格秉持了对具体争议的价值中立,也正因为如此反而轻松地恪守了新闻报道的基本操守。
反观前一阵子国内媒体,在初期对这一重磅论文的报道是没有问题的,是基于对 nature 的信任、基于对科学家的信任。问题出现在出现争议之后。围绕对 NgAgo 及韩春雨的质疑,预设了立场,而且直接体现在文稿之中,有一些报道,也许也知道不应该预设立场,但是还是忍不住夹带私货,故而充分发挥汉语言技巧,左躲右闪地暗中使劲儿,搞得自己挺累。媒体忘记了自己是第三方,夹杂着立场和情感混战进来,搞得好像没有第三方一样。
其实,这不是第一次,恐怕也不是最后一次。瓷国,被 “ 船堅炮利 ” 惊扰之后,清末民初,有识之士顿觉面临 “ 三千年未有之大变局 ” ,开出了各种药方,以图 “ 强国存种 ” ,自 “ 中体西用 ” 到 “ 德先生赛先生 ” ,君臣佐使。其中有个怪才杨度,兴许是 “ 议学 ” 的首倡者。什么是议学? parliamentary 。
几经周折后,社会主义救中国、改革开放、 WTO 、全球化,时至今日,中国俨然已成世界第二经济大国科技大国了,然而从熟人社会快速推进到陌生人社会,如何辩论公共话题,还需补课。前几年有本小册子《罗伯特议事规则》,算是向国人科普了如何辩论而保持体面,说来也简单,辩论双方轮流向第三方陈述观点!这样,至少不至于搞成乒乓球模式、比嗓门模式。
公共话题的讨论,媒体需要充当第三方,或者说有水准的媒体应该担当第三方。在中国,这很难。就是地震之类的灾难报道,我们的媒体与日本 NHK 相比,那种对职业操守的冷峻恪守,相差太大。
这次轮到科学话题了,更应该冷峻超然啊!难!预设太多,善意的预设、无知的预设、方黑方粉,诸如此类,搞得热热闹闹,最后一锅粥,只剩下观念之争、忘记了追寻事实真相,又一次地成为一哄而起、一哄而散的万民狂欢。
好在,仍有不少居庙堂之上及处江湖之远者还算有几份清醒。毕竟,中国正在融入世界,互联网缩小了这个地球村。这不, nature 的 news , David Cyranoski 的小清新文字,马上就来到了大家面前。各位看官,何必拒绝呢?