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[科普中国]-亲水指数

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某种氨基酸的亲水指数(hydropathy index)是一个描述其支链的亲水性或疏水性程度大小的值。“亲水指数”于1982年被Jack Kyte与Russell Doolittle提出。亲水指数越大,这种氨基酸的疏水性就越强。

简介某种氨基酸的亲水指数(hydropathy index)是一个描述其支链的亲水性或疏水性程度大小的值。“亲水指数”于1982年被Jack Kyte与Russell Doolittle提出。亲水指数越大,这种氨基酸的疏水性就越强。

亲水指数是根据蒸汽至水相转移的ΔtrGm以及在形成蛋白质时氨基酸在表面和内部的分布测算的。疏水性最强的两种氨基酸分别是异亮氨酸(亲水指数为4.5)与缬氨酸(亲水指数为4.2);亲水性最强的两种氨基酸分别是精氨酸(亲水指数为-4.5)和赖氨酸(亲水指数为-3.9)。

|| || 20种常见氨基酸的亲水指数(基于Kyte与Doolittle的数据,缩写符号参见氨基酸)

|| || Eisenberg consensus scale(ECS)提供的20种常见氨基酸的亲水指数

用途亲水指数在蛋白质结构的研究中十分重要。具有疏水性的氨基酸在蛋白质的三维结构中更常见于蛋白质的内部,而具有亲水性的氨基酸更常出现在蛋白质的表面。

另一个重要用途是预测膜蛋白在细胞膜中的分布。如果发现膜蛋白有连续二十个左右的氨基酸都具有较强的疏水性,那么很有可能这一段氨基酸是膜蛋白横跨细胞膜的部分。1

本词条内容贡献者为:

段春伟 - 教授级高工 - 中国新兴建设开发总公司