[科普中国]-生物模型数据库

BioModels Database是一个完全免费的，用来存储和交流数量型生物模型的数据库。 当前生物模型数据库得到自然出版集团(Nature Publishing Group)和PLoS的推荐和支持。

简介BioModels Database是一个完全免费的，用来存储和交流数量型生物模型的数据库。当前生物模型数据库得到自然出版集团(Nature Publishing Group)和PLoS的推荐和支持。

BioModels Database是一个免费的生物模型在线数据库。数据库中主要存储数量型生物化学模型。所有的模型都是在相关的科学文章中发表过的并且经过了同行评审。

所有BioModels Database中的模型都是已经发表在各种学术刊物上的，并且被验证人员用模拟软件模拟验证过的。所有模型中的元素都被连接到相关参考数据库，方便用户快速获得相关详细信息。

生物学家可以以SBML和CellML两种格式上传生物模型。当模型上传后，会自动转换为以下格式供生物学家下载使用：SBML, CellML, XPP, SciLab, BioPAX和一些图形格式，如GIF, SVG和applet。1

学术期刊的支持当前BioModels Database得到很多期刊的支持。当一个生化模型的科研人员在发表关于生化模型的学术文章前，这些期刊会推荐作者将模型存在BioModels Database里。当文章发表时，读者便可以直接从BioModels Database中下载模型。目前，支持BioModels Database的期刊包括自然出版集团(Nature Publishing Group)的Molecular Systems Biology、PLoS的所有期刊、BioMed Central的所有期刊和Royal Society of Chemistry的所有期刊。2

研发与维护机构BioModels Database由以下机构合作开发：位于英国剑桥的欧洲生物信息研究所（EBI）的运算神经生物学组(Computational Neurobiology Group)；美国加利福尼亚Keck Graduate Institute的SBML组和日本Systems Biology Institute以及 JWS Online, Stellenbosch University, ZA。

目前BioModels Database主要由欧洲生物信息研究所的BioModels.net团队负责维护。2

研发资金来源BioModels Database的研发得到以下组织的资助：欧洲分子生物实验室（European Molecular Biology Laboratory）和美国National Institute of General Medical Sciences。2

本词条内容贡献者为:

王沛 - 副教授、副研究员 - 中国科学院工程热物理研究所