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[科普中国]-水稻基因组

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在2002年4月5日出版的《Science》上发表了由中国 12家科研单位共同完成的水稻 籼稻 (Oryza Sativa ssp.indica)亚型的基因组序列。该水稻基因组全长是 4 6 6× 10 7个碱基对,含有 4 6 0 2 2到 5 5 6 15个基因 ,功能基因占基因组的 92 .0 %。

在同期的《Science》上,还发表了由美国 6家科研机构共同完成的水稻 粳稻 (Oryza sativa L. ssp. japonica)亚型的基因组序列。该亚型的基因组全长 4 2 0× 10 7个碱基对 ,含有 32 0 0 0到 5 0 0 0 0个基因。

背景水稻是世界上最重要的粮食作物,全球近半数人口以其为生。水稻基因组是迄今为止开展基因组测序的最大植物基因组,约为人类基因组的1/7,约4.3亿对碱基,共12条染色体。通过对水稻全基因组序列分析,可以获得大量的水稻遗传信息。

籼稻基因组测序材料:93-11

来源:中国

2001年10月12日,中国科学院、科技部和国家计委联合向全世界宣布,中国率先完成水稻(籼稻)基因组工作框架图的绘制,并免费公布数据库。数据库的无偿使用,得到了国内外同行的一致好评。迄今,有22个国家、超过20万人次访问了我国水稻数据库,下载数据千次。2002年4月5日,国际最权威的《科学》杂志以14页的篇幅发表《水稻(籼稻)基因组的工作框架序列图》。

此次公布的水稻基因组“精细图”是第一张农作物的全基因组精细图。对基因预测、基因功能鉴定的准确性以及基因表达、遗传育种等研究的贡献是一个质的飞跃。2002年5月28日,江泽民主席在两院院士大会上的讲话中将其列为近代中国生命科学对世界三个主要贡献之一。1

粳稻基因组测序材料:日本晴

来源:日本

由日本科学家牵头的“国际水稻基因组计划”(IRGSP)正式启动,选取日本主要栽培品种——粳稻“日本晴”为研究材料。随后,美国Mensanto公司和瑞士Syngenta公司相继开展了对“日本晴”的基因组测序研究工作。2

3000份水稻基因组由中国科学家主导完成的Nature长文,通过对3010份水稻基因组的分析提出亚洲栽培水稻起源的新观点并恢复命名,90年前由日本学者对“籼”、“粳”稻分别命名的indica(Oryza sativa L. subsp. indica Kato)和japonica(Oryza sativa L. subsp. japonica Kato)终于恢复为“籼”(Oryza sativa subsp. xian)、“粳”(Oryza sativa subsp. geng)亚种的正确命名,使中国源远流长的稻作文化得到正确认识和传承。同时,我们也欣喜的看到该Nature论文的正文中还出现了“籼”和“粳”的汉字。3

本词条内容贡献者为:

魏大勇 - 副教授 - 西南大学