北京新冠疫情出现新情况后全市集食品及环境涂抹标本展开大排查,发现了40件环境阳性样本。环境核酸检测是如何进行的?
撰文/记者 刘大珩(医疗健康组)
编辑/廖迈伦 新媒体编辑/陈炫之
自从北京新冠疫情出现新情况之后,全市的农贸批发市场、大型超市都展开了排查。根据6月12日的发布会上公布的信息,当时共采集海鲜、肉类等食品及外环境涂抹标本5424份,完成新冠病毒核酸检测,新发地市场发现40件环境阳性样本。根据新发地董事长张玉玺接受采访时表示,相关部门从切割三文鱼的案板上检测到了新冠病毒。
在以往的新冠疫情检测中,大家对咽拭子、鼻拭子等核酸检测的取样方式已经比较熟悉,那么这次新出现的"食品及外环境涂抹标本"和"环境样本"又是怎么回事呢?
环境样本检测是如何进行的?
在对环境样本进行采样时,一般会采用表面涂抹采样的方法。通过拭子擦拭样本表面进行采样,检测样本中是否存在病毒的RNA。
▲表面涂抹取样(图片来自网络)
表面涂抹采样法其实是一种十分常见的方法,平时主要用于食品表面、化妆品中的微生物监测,制药企业无菌车间的清洁度监测以及公共场所消毒效果监测。在本次疫情中,对新发地的环境样本检测也使用了这一方法。
与给患者进行核酸检测相同,检测人员同样需要在试剂的帮助下,将样本中的核酸提取出来。再把已经分离出来的核酸加到核酸扩增试剂中,然后将其放到核酸扩增仪内,一般两个小时内就会有结果。
不同的是,环境样本采样时用的拭子与取样样品表面接触面积更大,而且拭子头部具有较强的亲水性。另外,在对大件物体进行采样时,需要在物体表面选取4个位置,放置5cm×5cm大小的规格板,用无菌生理盐水采样液浸湿的棉拭子在规格版内横竖往返各涂抹5次,随之转动棉拭子,并连续采样4个规格板面积;对于小于100平方厘米的小件物体,需要用采样液浸湿的棉拭子直接涂抹物体全部表面,并随之转动棉拭子。最后,在收集样本于试管时,棉拭子需要去掉采样人手指接触的部分。、
多种情况可能影响环境样本检测准确性
在环境标本的运输过程中,时间、温度等因素可以直接影响结果的准确性,而且在环境中,存在大量对RNA有强烈水解作用的RNase(核糖核酸酶,广泛存在于人的皮肤、唾液、汗液以及周围环境中)。因此在采样时,要注意这种酶可能带来的影响。一般情况下,采集到的标本要在4℃的环境下冷藏保存,且必须要在4小时以内送到实验室进行检测。
由于病毒不能在离开活细胞后存活太久,因此病毒在体外的活性取决于其所依附物体的表面温度、湿度等环境状况。北京地坛医院感染二科主任医师蒋荣猛在接受记者采访时表示,新型冠状病毒在光滑的物体表面,可以存活数小时。如果温度、湿度合适有可能存活数天,比如在温度20℃、湿度40%-50%的环境中,有研究发现病毒可能存活达到5天。
然而,不论是人体核酸检测还是环境样本检测,扩增均是操作步骤中很重要的一环。扩增的意义在于能让微量的遗传信息成指数增加。只要样本中有核酸基因片段,就能用PCR法加以放大,从而更清晰地与病毒全基因组序列实现比对。中日友好医院呼吸与危重症医学科主任医师陈欣介绍称,核酸检测十分敏感,只要在样本中找到一部分病毒的核酸,就可以通过RT-PCR(实时荧光逆转录聚合酶链反应)扩增的方式,整合成序列。
如果从来自环境的样本中找到了新冠病毒的核酸,那么可以称为环境样本阳性。
为何会在三文鱼切割案板上检测出新冠病毒?
显然,检测出新冠病毒的三文鱼案板属于环境样本。那么为何在三文鱼切割案板上发现新冠病毒?
中国疾病预防控制中心流行病学首席专家吴尊友在接受中央纪委监察委网站采访时表示,不能因为在切割进口三文鱼的案板中检测到了新冠病毒,就下结论说三文鱼就是传染源。
他分析了三文鱼案板上检出新冠病毒的几种可能性,"接触到案板的所有人或物品都有可能。比如,可能案板的主人就是一个新冠病毒感染者,他在讲话过程中飞沫落到了案板上;比如,可能前来采购的客人是新冠病毒感染者,他在案板前待的时间比较长,在与主人交流或砍价的讲话过程中,也可能造成案板被污染;比如,可能案板主人销售的其他物品是被污染的,带有新冠病毒,也可以污染案板。"
这也说明,环境样本携带病毒的情况比较复杂,"需要通过不同渠道搜集采样来验证,评估到底哪一种可能性更大。新发地批发市场人流大,销售的物品品种太多太复杂,不是在很短时间就能理得清楚的。只有把所有人流和物品都查清楚了,才有可能展现出全貌。"吴尊友说。
参考资料:
[1]薛泽润, 栾阳, 陈海龙,等. 新型冠状病毒肺炎周围环境中病毒的监测[J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2020, 34(00):E011-E011.
[2]甘源. 多次涂抹法检测物体表面细菌总数[J]. 中国消毒学杂志, 2003(02):68-69.
[3]批发市场为何易成疫情暴发点——访中国疾病预防控制中心流行病学首席专家吴尊友,中央纪委监察委网站,2020年6月14日,
http://www.ccdi.gov.cn/yaowen/202006/t20200614_220074.html
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