[科普中国]-常用核酸序列数据库

简介三大核酸数据库

DNA测序技术的迅速发展，使人类已知的DNA核酸序列不断增长，常用核酸序列数据库数据库综合了DNA和RNA序列数据，其数据源于众多的研究机构和核酸测序小组，以及科学文献。数据库中的每条记录代表着一条单独的、连续的、附有注释的DNA或RNA片段。在国际上逐渐建立了以GenBank、EMBL、DDBJ为代表的三大核酸序列数据库。1988年，三大数据库共同成立了国际核酸序列数据库联合中心，三方达成协议，对数据库的数据更新同步。对于特定的查询，三个数据库的响应结果一致，仅在数据格式上有细微的差别。

功能进行分子生物学研究，更新常用核酸序列信息，学术交流，同时面向全世界研究者提供数据库当中的相关数据。

EMBL欧洲分子生物学实验室（EMBL）是一个分子生物学研究机构，由22个正式成员国，4个有前景的成员国家和2个准成员国共同成立。成立于1974年的EMBL是由来自其成员国的公共研究资金资助的政府间组织。 EMBL的研究由涵盖分子生物学谱的约85个独立组同时进行。

实验室包含海德堡的主要实验室和Hinxton的外部站（英国的欧洲生物信息学研究所（EBI）），格勒诺布尔（法国），汉堡（德国）和蒙特罗通多（罗马附近）。 EMBL小组和实验室在分子生物学和分子医学方面进行基础研究。 该组织帮助其成员国在新仪器以及生物技术方面的发展。其中，以色列是唯一拥有正式成员资格的亚洲国家。1

GenBankGenBank序列数据库是所有可公开获得的核苷酸序列及其蛋白质翻译的开放数据库。该数据库由国家生物技术信息中心（NCBI）作为国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分运行和维护。国家生物技术信息中心是美国国家卫生研究院的一部分。 GenBank及其合作者接收来自超过100,000种不同生物体的世界各地实验室产生的序列。自成立以来的30多年中，GenBank已成为几乎所有生物领域研究最重要和最具影响力的数据库，其数据被世界各地数以百万计的研究人员访问和引用。 GenBank继续以指数速率增长，每18个月增加一倍。2

DDBJ日本的DNA数据库（DDBJ）是收集DNA序列的核算序列数据库，位于日本静冈县的国家遗传学研究所（NIG）。它也是国际核苷酸序列数据库组织INSDC的成员，每天与欧洲生物信息学研究所的欧洲分子生物学实验室和国家生物技术信息中心的GenBank交换数据。因此，这三个数据库在任何给定时间包含相同的数据。3

DDBJ于1986年在NIG开始了数据库活动，并且仍然是亚洲唯一的核苷酸序列数据库。尽管DDBJ主要从日本研究人员那里获得数据，但它可以接受来自任何其他国家的贡献者的数据。 DDBJ有一个国际咨询委员会，由9名成员组成，每个成员来自欧洲，美国和日本3个成员。