同一品种,全球各地的苹果微生物组有差异
你可能不知道,一个普通的苹果含有约1亿个细菌。苹果中的细菌来自许多不同的类群。其中很少细菌是致病的,大多数是无害的,有些甚至是有益的。这些细菌主要分布在果皮和果核,只吃果肉你将错过大部分细菌,而这些细菌可能是人体需要的。
这个发现颠覆了很多人的认知,水果和蔬菜中本身有的微生物引起了大家的注意,他们会被你吃到肚子里。
苹果的皇家嘎拉(Royal Gala)最初是新西兰由嘎拉中选出的品种。
最近有研究采集了全球8个国家(美国、加拿大、乌拉圭、意大利、西班牙、瑞士、以色列和土耳其)的21个地点的皇家嘎啦苹果,并检测了里面的微生物组。
结果发现,每个调查国家的苹果都有90种真菌和57种细菌。
苹果的核心微生物群由6个真菌属(Aureobasidium,Cladosporium, Alternaria, Filobasidium,Vishniacozyma和Sporobolomyces)与两个细菌属(Sphingomonas和Methylobacterium)组成。
意大利的真菌多样性最高,其次是土耳其和以色列。而意大利,美国和瑞士采集的苹果中细菌多样性最高。
其中,土耳其的真菌属数量最多(25个),其中包括Penicillium,Zasmidium和Pseudomicrostroma。相比之下,西班牙的真菌属数量最少(5个),其中包括Monilinia、Vishniacozyma和Bensingtonia。以色列和美国西部的独特细菌类群数量最多,而在乌拉圭采集的样本中,只有一种细菌类群被鉴定为Paenibacillaceae。
相对于北美东部和南美(美国东部,加拿大和乌拉圭)样品中的细菌群落,欧洲(瑞士,意大利和西班牙)样品中的细菌群落彼此更相似,估计是距离较近。土耳其和以色列的苹果似乎有一个独特的细菌群落。真菌群落组成,从美国西部,意大利,西班牙和以色列采集的苹果与由美国东部,加拿大,乌拉圭和瑞士采集的苹果形成了单独的聚类。
此外,在同一国家的果园中采集的样品中的微生物群落更相似。在真菌群落中比在细菌群落中更为明显。
在大多数的果园中,花萼末端组织表现出更高的真菌多样性,其次是果皮和茎末端组织,只有在从乌拉圭,土耳其和西班牙采集的样品中观察到少数例外。
相比之下,组织类型对细菌多样性有重要影响,而与采样位置无关。除了加拿大采集的样品,茎末端组织拥有最高的细菌多样性。
此外,组织类型以及组织类型与国家之间的相互作用以及组织类型与果园之间的相互作用都对真菌群落组成具有重要影响。
虽然,在90%的样本中没有发现任何细菌属,但真菌属的Aureobasidium和Cladosporium在96%的样本中被发现。有趣的是,Sphingomonas的群落组成能够很好地区分大多数被调查国家的果实,并且显示出果实内的生态位特化,因为茎端、花萼端和果皮组织拥有不同的Sphingomonas群落。
也许这种独特的细菌,可以用来区分不同国家和不同产地的同一种苹果。
这是我们对苹果中微生物的首次全面认识,至于这些微生物和肠道中的微生物有什么关系,是需要进一步搞明白的。
当你知道苹果中有这么多样的微生物时,你还敢吃苹果?再吃时会有什么样的想法?
Global analysis of the apple fruit microbiome: are all apples the same?
doi.org/10.1111/1462-2920.15469