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地球生物基因组计划开始认真地进行基因组测序

中国绿发会
原创
长期致力生态文明建设、生物多样性保护与绿色发展
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编者按:近日,加州大学戴维斯分校发布了一篇《地球生物基因组计划开始认真地进行基因组测序》。中国生物多样性保护与绿色发展基金会(简称中国绿发会)作为地球生物基因组计划(EBP)的全球44家成员机构之一、中国第二家成员机构,编译分享如下。近日,EBP还会有更多的新闻出来。敬请关注。

一项绘制地球上所有植物、动物、真菌和其他微生物生命的基因组图的全球努力,正进入一个新的阶段,因为它从试点项目转向全面生产测序。地球生物基因组计划(EBP)的这一新阶段以本周发表在《美国国家科学院院刊》上的一组论文为标志,描述了该项目的目标、迄今取得的成就和下一步行动。

"EBP工作组主席、加州大学戴维斯分校进化与生态学特聘教授哈里斯-莱文说:"关于EBP的专题报道抓住了生物学历史上最大规模的协调努力的本质和兴奋点。"从基础科学到跨越广泛的全球紧迫问题的突破性应用,如防止生物多样性的丧失和使粮食作物适应气候变化,EBP在真核生物测序方面的进展是令人惭愧和鼓舞的。实现对所有真核生物进行测序的最终目标,现在看来我们已经触手可及"。

EBP于2018年11月启动,其目标是提供所有180万种命名的植物、动物和真菌以及单细胞真核生物的完整DNA序列目录。

据预测,如果不采取行动遏制气候变化和保护全球生态系统的健康,到本世纪末地球将失去50%的生物多样性。为所有已知的真核生物创建一个DNA序列的数字图书馆,可以帮助产生有效的工具,以防止生物多样性的丧失和病原体的传播,监测和保护生态系统,并加强生态系统服务。

【网络的网络】

该项目作为一个国际网络的网络,协调众多特定群体、区域和国家规模的工作,如加州保护基因组项目(美国)、达尔文生命之树项目(英国和爱尔兰)、脊椎动物基因组项目和万鸟基因组项目。

该项目的行政办公室位于加州大学戴维斯分校的基因组中心。该中心也是加州保护基因组学项目的主要DNA测序中心,该项目是由加州大学洛杉矶分校的Bradley Shaffer教授领导的全加州项目,旨在协助加利福尼亚州利用基因组学工具管理濒危和具有经济意义的物种。

【第一阶段的目标】

EBP的前两年,即2018-20年,代表启动阶段。第一阶段的目标,到2023年,是产生代表约9400个分类科的参考基因组。到目前为止,附属项目已经产生了大约200个这样的参考基因组,预计到2022年底将完成3000多个的测序、组装和注释,占第一阶段目标的大约三分之一。

截至2021年12月,该项目包括除南极洲外各大洲22个国家的44个成员机构的5000名科学家和技术人员。有49个附属项目,涵盖了真核生物的大多数主要分类群,这些项目可以从博物馆藏品和野外生物学家那里获得数以万计的高质量样本。最近,一个由22个国家的非洲机构组成的小组作为非洲生物基因组项目上线。正在实施DNA条形码技术以发现和识别物种的BIOSCAN,以及努力发现可能构成大流行威胁的新病毒的全球病毒组项目,也已加入成为附属机构。

前三年的主要活动包括制定和评估标准和战略,组织区域、国家和跨国项目,并通过定期工作委员会会议和年度会议建立社区。

除了负责制定项目标准的国际科学委员会外,EBP还成立了伦理、法律和社会问题以及正义、公平、多样性和包容委员会。EBP在了解围绕项目的伦理、法律和社会问题方面的积极立场,将为生物多样性基因组学界和世界上生物多样性最丰富的国家内的原住民社区提供有关获取和利益分享、公平和包容的建议。

【绿讯】是中国绿发会国际部发挥智库功能、为了推动中国深度参与全球环境治理推出的一系列全球环境治理的最新的动态。译文仅供参考。

编译:SY(绿会国际部)
审核:绿茵

评论
飞马腾空
太师级
2022-01-20
smxh676
大学士级
生物多样性基因组学界和世界上生物多样性最丰富的国家内的原住民社区提供有关获取和利益分享、公平和包容的。
2022-01-19
张玉龙!
贡士级
点赞
2022-01-20