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啥情况? 苏州出现与全球已知毒株不同源变异株!

李雷
原创
中科院生物学博士。擅长生物、医学、健康。年更新近300图文
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3月28日,苏州常熟市发现的一例轻型确诊病例杨某,其感染的病毒,经测序对比为VOC/Omicron变异株BA.1.1进化分支,在本土病例和输入病例数据库、全球新冠病毒GISAlD数据库中均未发现新冠病毒基因组高度同源序列。

经过两年多的抗疫,人们对新冠可谓深恶痛绝,但新冠却仍旧不厌其烦地变着花样来干扰人们的生活。这不,继新毒王XE后,在苏州又发现一例新的变异株 BA.1.1 ,与全球已知毒株不同源。这还真的没完没了了!抗疫之路任重道远啊!

今天就来和大家说说苏州发现的新变异株,对我们来说意味着什么?在我们的疫情防控方面有哪些注意事项!

01,新病毒株

先定义为病毒株,根据进化发展情况再看是否要变成分支(也就是后续有没有规模扩散)

刚看到这个新闻,第一时间去gisaid 里查了下,结果没找到~

最近一次上传是3月11日,而苏州这个序列还没上传到gisaid 。所以只能等看到序列后再分析。目前有几个事情可以探讨的。

02,官方分析属于BA.1.1

苏州官方分析属于BA.1.1,但是属于这一支下面的新变异,目前全球未报道过该变异株。

不过其实也很正常,新冠有很多毒株,初步不下几千,但是大部分毒株也就是出现了,然后就没然后了。最终形成气候的,一定是那种某一方面或者几方面都具备优势的毒株,最后成为了大家公认的xx进化分支。

事实上,哪怕是大家如今肆虐全球的奥密克戎,从出现到变异成强大病毒株,也经历了不短的时间。

而这期间,其他的不少毒株根本就扩散不下去。

形成真正传播性的几个毒株也是某一时刻获得了关键性变异,从而让他们可以取得了传播上的优势。

03,扩散速度方面

从国际上BA.1.1扩散速度一般,比不上BA2,所以基于这一点,可以初步心理有个底,不需要特别的倾尽全力去防它。当前还是集中精力应对某地的BA2吧。

不过总体上,相比于最早的新冠,都有不小的变化(下图是spike receptor-binding domains (RBDs) 以及人类ACE2的结构,可以像找茬一样肉眼看得到差异)

04,这病毒株咋来的?

说了这么多,最令人好奇的是,这病毒株是咋来的?

目前国内是BA 2,要知道从BA 2变成BA 1.1,那难度是相当的大。所以昨天也和一些朋友探讨过,觉得直接变过来可能性较小。但是它就是出现了,所以,它到底从何而来???

大家可以看一下BA2和BA1之间的差异,突变这么多,还要如此精准,这是被定向基因编辑了么?

所以有三个可能:

1,苏州测错了-重测,确认(但是考虑到既然开发布会了,那大概率是真的,但是还是要进一步检测,看到底多真实,这个时候就不能用二代测序了,而是要上金标准一代测序来看了。)

2,这个病毒有其他独立来源-溯源,病毒不可能无中生有(这个是重点要做的),事实上,一个独特的毒株出现,一定有前期的变异历史沿革,这一过程肯定也是漫长的。

我们这段时间的确没有进行大规模的全基因组测序,所以可能已经存在不少感染了这一支毒株的,但是没有进行大规模全基因组测序,所以没有发现。

(核酸检测是检测不出毒株的,要进行毒株鉴定必须全基因组测序)

3,这个病毒天赋异禀。由BA2变成BA1-无语(那只能说是小概率事件发生了),罕见到难以置信的地步。

就像下图,BA1和BA2差异那是相当的大

评论
机灵的和蔼可亲军师
庶吉士级
病毒的复制与更新也是有规律可循
2022-04-10
Fu Jicai
少师级
认识病毒变异规律!
2022-04-12
科普61a360c517ff6
学士级
新冠有很多毒株,初步不下几千,但是大部分毒株也就是出现了,然后就没然后了。最终形成气候的,一定是那种某一方面或者几方面都具备优势的毒株,最后成为了大家公认的xx进化分支
2022-04-13