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[科普中国]-半胱氨酸数

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概述

自然界中,大多数蛋白质都含有半胱氨酸残基,半胱氨酸残基之间可以形成二硫键,而二硫键对蛋白质的三级和四级结构的稳定性是非常重要的。二硫键可以使蛋白质免受损坏,并且可以增加蛋白质的半衰期,因此二硫键可以维持蛋白的稳定性。

原理4-乙烯吡啶可以结合半胱氨酸,从而阻止半胱氨酸形成二硫键,因此,一个4-乙烯吡啶可以和一个半胱氨酸结合。在提取蛋白质样品时,一组样品加入4-乙烯吡啶,另一组样品不加4-乙烯吡啶,然后进行质谱鉴定。增加的分子量和该蛋白质所含有的半胱氨酸数目相关,即高分子量蛋白每含有一个半胱氨酸残基,其分子量会相应增加大约105.14Da(即一个4-乙烯吡啶的分子量)1。

计算方法首先通过质谱获得同一种蛋白在两种处理(用4-乙烯吡啶处理和未用4-乙烯吡啶处理)下的分子量分别是多少,然后用4-乙烯吡啶处理过的分子量减去未用4-乙烯吡啶处理的分子量,最后再除以105,得到的结果就是该待测蛋白中所含有的半胱氨酸残基的数目。

质谱鉴定条件采用AppliedBiosystems公司生产的质谱仪器4800,质谱参数为激光强度2500,质量范围65-95kDa,加速电压25kV,板极电压92%,尺度0.3%,延迟时间1000ns。对获得的蛋白质质量谱利用软件进行数据处理分析2。