[科普中国]-RNA数据库

RNA分类及作用

三种常见的RNA

1、mRNA 信使RNA 功能：蛋白质合成的直接模板

2、tRNA 转运RNA 功能：氨基酸的运载体

3、rRNA 核糖体RNA 功能：核糖体的组成成分，蛋白质的合成场所

其他小分子RNA

1、hnRNA 核内不均一RNA 成熟mRNA的前提

2、snRNA 核内小RNA 参与hnRNA的剪接与转运

3、snoRNA 核仁小RNA rRNA的加工与修饰

4、scRNA/7SL-RNA 胞质小RNA 蛋白质内置为定位合成信号识别体组成成分

5、siRNA 小的干扰RNA siRNA在RNA沉寂通道中起中心作用，是对特定信使RNA（mRNA）进行降解的指导要素

RNA数据库NONCODE1、NONCODE科学数据库是中国科学院计算技术研究所生物信息学研究组和中国科学院生物物理研究所生物信息学实验室共同开发和维护的一个提供给科学研究人员分析非编码RNA基因的综合数据平台。

2、长短不一、结构各异的非编码 RNA 在生物体中发挥着各种不同功能，如 snRNA参与 mRNA 剪接、 snoRNA 参与rRNA 的甲基化和假尿嘧啶化加工、 gRNA 参与RNA 编辑、SRP-RNA 参与蛋白质的细胞定位、端粒 RNA参与 DNA端粒合成并影响细胞的寿命、 tmRNA 参与终止受损的mRNA 的蛋 白质合成过程、Xist 能使X染色体失活、piRNA参与调控染色体表观遗传修饰等。1

starBase一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。

miRbasemicroRNA是基因注释数据库。miRBase数据库检索数据库发表的miRNA序列和注释。在miRBase序列数据库的每个条目代表一个预测的miRNA转录发夹部分在成熟的miRNA序列的位置和序列信息。