《Cell》丨在哪个重要节点上,蛇的基因组演化“转轨”了?
全基因组序列极大似然法重构的31物种(6个外群和25种蛇)系统基因组学框架
蛇起源于早白垩纪,是爬行纲动物演化史中最迟出现的类群。每每提及蛇,都可以想象到它游走时蜿蜒流动的线条和身上美丽而象征危险的复杂纹样。然而就是这样一种习以为常的古老动物,从科学角度而言,人类对它的了解还远远不够。近日,中国科学院成都生物研究所李家堂研究团队选取了全球极具代表性的蛇类物种,整合谱系基因组学、大规模比较转录组学分析方法及基因编辑等实验技术,综合探讨了蛇类起源及表型演化的遗传机制。
研究团队表示,目前全球已知蛇类约有4000种,广泛分布于除南极洲外的各大洲陆地和海洋,栖息地多样,适应能力强,以高度特化的重要表型如四肢缺失、身体延长、视觉和听觉退化、红外感应增强、左右肺不对称发育等特殊表型,在进化历史上处于脊椎动物演化的关键节点,是脊椎动物重要类群和研究动物复杂性状形成机制的理想类群。
具体来看,该研究重构的蛇类祖先基因组由23对染色体组成,其中包含8对大染色体和15对小染色体。蛇类Z染色体可能起源于蜥蜴的常染色体且在整个蛇类演化中,至少发生过一次断裂。基因组大小与转座子含量的高低呈显著正相关关系,这与蛇类基因组大小与转座子含量无关的结论(之前基于短序列测序提示的结论)是不一致的。与鸟类、哺乳类动物相反,蛇类基因组的GC含量向着降低的方向演化,表明其基因组演化道路可能不同于其它脊椎动物类群。
该研究成果对理解脊椎动物演化历史具有重要意义,将推动动物演化生物学等相关学科的发展。